區(qū)分不同的票種，具體處理方法如下：
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增值稅紙質(zhì)發(fā)票
一? 紅字增值稅普通發(fā)票 納稅人向代開稅務(wù)機關(guān)退回紙質(zhì)發(fā)票全部聯(lián)次的，由代開稅務(wù)機關(guān)通過金稅三期工程核心征管系統(tǒng)開具紅字普票（申請紅字專票需在增值稅發(fā)票管理系統(tǒng)中申請《開具紅字增值稅專用發(fā)票信息表》（以下簡稱《信息表》）。紅字普票的全部聯(lián)次由代開稅務(wù)機關(guān)留存，無需交付納稅人。 二? 紅字增值稅專用發(fā)票 政策依據(jù) 根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于紅字增值稅發(fā)票開具有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2016年第47號）第一條規(guī)定：增值稅一般納稅人開具增值稅專用發(fā)票（以下簡稱“專用發(fā)票”）后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應(yīng)稅服務(wù)中止等情形但不符合發(fā)票作廢條件，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓，需要開具紅字專用發(fā)票的，按以下方法處理： 1.購買方取得專用發(fā)票已用于申報抵扣的，購買方可在開票軟件中填開并上傳《增值稅專用發(fā)票紅字信息表》，在填開《信息表》時選擇“購買方申請-已抵扣”，不必填寫對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息，應(yīng)暫依《信息表》所列增值稅稅額從當(dāng)期進項稅額中轉(zhuǎn)出，待取得銷售方開具的紅字專用發(fā)票后，與《信息表》一并作為記賬憑證。 購買方取得專用發(fā)票未用于申報抵扣、但發(fā)票聯(lián)或抵扣聯(lián)無法退回的，購買方填開《信息表》時應(yīng)填寫相對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息。 銷售方開具專用發(fā)票尚未交付購買方，以及購買方未用于申報抵扣并將發(fā)票聯(lián)及抵扣聯(lián)退回的，銷售方可在開票軟件中填開并上傳《信息表》。銷售方填開《信息表》時應(yīng)填寫相對應(yīng)的藍(lán)字專用發(fā)票信息。 2.主管稅務(wù)機關(guān)通過網(wǎng)絡(luò)接收納稅人上傳的《信息表》，系統(tǒng)自動校驗通過后，生成帶有“紅字發(fā)票信息表編號”的《信息表》，并將信息同步至開票軟件中，納稅人可查詢或?qū)С觥凹t字發(fā)票信息表”，獲取信息表編號。 3.銷售方憑稅務(wù)機關(guān)系統(tǒng)校驗通過的《信息表》，輸入“紅字發(fā)票信息表編號”開具紅字專用發(fā)票，在開票軟件中以銷項負(fù)數(shù)開具。紅字專用發(fā)票應(yīng)與《信息表》一一對應(yīng)。 4.納稅人也可憑《信息表》電子信息或紙質(zhì)資料到稅務(wù)機關(guān)對《信息表》內(nèi)容進行系統(tǒng)校驗。 第二條規(guī)定：稅務(wù)機關(guān)為小規(guī)模納稅人代開專用發(fā)票，需要開具紅字專用發(fā)票的，按照一般納稅人開具紅字專用發(fā)票的方法處理。 根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于修訂<增值稅專用發(fā)票使用規(guī)定>的通知》（國稅發(fā)〔2006〕156號）第二十五條規(guī)定：用于抵扣增值稅進項稅額的專用發(fā)票應(yīng)經(jīng)稅務(wù)機關(guān)認(rèn)證相符（國家稅務(wù)總局另有規(guī)定的除外）。認(rèn)證相符的專用發(fā)票應(yīng)作為購買方的記賬憑證，不得退還銷售方。 ??? 機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票 政策依據(jù) 根據(jù)《國家稅務(wù)總局 工業(yè)和信息化部 公安部關(guān)于發(fā)布<機動車發(fā)票使用辦法>的公告》（國家稅務(wù)總局 工業(yè)和信息化部 公安部公告2020年第23號）第九條第（三）點規(guī)定：銷售方開具紅字發(fā)票時，應(yīng)當(dāng)收回消費者所持有的機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票全部聯(lián)次。如消費者已辦理車輛購置稅納稅申報的，不需退回報稅聯(lián)；如消費者已辦理機動車注冊登記的，不需退回注冊登記聯(lián)；如消費者為增值稅一般納稅人且已抵扣增值稅的，不需退回抵扣聯(lián)。 ??? 增值稅電子專票 政策依據(jù) 根據(jù)《關(guān)于<國家稅務(wù)總局關(guān)于在新辦納稅人中實行增值稅專用發(fā)票電子化有關(guān)事項的公告>的解讀》第九條規(guī)定：納稅人開具電子票后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應(yīng)稅服務(wù)中止、銷售折讓等情形，可以開具紅字電子專票。相較于紅字紙質(zhì)專票開具流程，納稅人在開具紅字電子專票時，無需追回已經(jīng)開具的藍(lán)字電子專票，具有簡便易行好操作的優(yōu)點。